m6A助力过气网红miRNA国自然和高分文章双双齐涨 | m6A专题
我们先来回顾下过去公众号刚刚发布的两篇关于m6A的热门爆款文,来理一下自己的科研思路:
① 截止2019年7月m6A热点领域10分+研究盘点 | m6A专题
miRNA一直被认为是过气网红,但是从今年国自然的资助总额来看,依旧有多达3亿元的项目中标。
虽然大家都知道,作为一家低调的测序公司,联川客户在miRNA方面的CNS文章多如天上的繁星。但同样作为一家负责任的miRNA服务商,我们也有义务帮助老师在miRNA上玩出新的花样。
目前,单纯去玩miRNA当然既无法中国自然,也无法发表高水平的研究论文。那么这个“被人嫌弃”的miRNA究竟该玩点儿什么套路呢?
外泌体当然是OK的,今年总计有2.5亿元的外泌体项目被资助。除了外泌体miRNA,ceRNA机制也已经被彻底玩烂了。当然miRNA促进翻译机制也属于新机制,是一个值得关注的新角度,但是不太好做。
怎么办呢?
还记得去年7月,我们在公众号曾经刊登过一篇文章——miRNA怎样蹭上m6A的热点发高分?| m6A专题。许多老师纷纷表示,自己处于停滞的项目终于有了一个突破口。
我们再来回顾一下,m6A该怎么跟miRNA“勾搭”上~
早在2015年,联川生物客户在世界上首次证实miRNA加工与m6A修饰相关。一篇Nature(m6A调控miRNA初级体识别加工)是关于METTL3参与pri-miRNA上的m6A修饰,敲低METTL3影响了pri-miRNA上m6A修饰,继而降低miRNA成熟体的表达量。一篇Cell(m6A识别酶HNRNPA2B1介导RNA加工)证实了pri-miRNA上m6A被HNRNPA2B1这个reader识别后激活pre-miRNA加工通路,继而影响成熟体的加工。
2017年1月,天津医科大学和南开大学两所高校联合在著名的老牌期刊Journal of Biological Chemistry上发表了一篇名为“MicroRNA-145 Modulates N6-Methyladenosine Levels by Targeting the 3’-Untranslated mRNA Region of the N6-Methyladenosine Binding YTH Domain Family 2 Protein”的文章。
YTHDF2作为reader行使识别带有m6A修饰的mRNA并将其降解的功能。而YTHDF2被miR-145抑制后,mRNA整体的m6A水平发生显著上调。
中山大学肿瘤防治中心孙颖/马骏团队思路与同济大学的康九红团队(linc1281上m6A修饰影响胚胎干细胞分化)思路比较接近,发现在鼻咽癌特定的lncRNA上带有m6A修饰从而影响ceRNA调控。
林东昕/郑健课题组及徐瑞华课题组则是经典的m6A修饰影响下游miRNA调控的套路,在胰腺癌中首次发现m6A修饰直接介导miR-25-3p加工。
同样的套路,也被南京医科大学的杨海伟课题组以及魏继福课题组在膀胱癌上玩了一次,METTL3在膀胱癌中直接介导pri-miR-221初级体加工,从而影响miR-221成熟体数量。
所以,联川生物建议,如果有打算做m6A项目的老师可以使用同样的样本搭配做一个miRNA测序可能会有惊喜和意外收获,让这个过气网红焕发第二春。
做m6A我们是专业的,做小RNA我们也是专业的,让我们一起努力,发挥1+1>2的效果吧!
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